Existe uma alternativa para quem não consegue fazer funcionar sua pen drive no Windows 98 SE,

1. Remova todos os drivers existentes de memória flash USB disponíveis no sistema;

2. Instale o programa Maximus Decim Native USB ver.2.2;
(link = www.flashdrive.com.br/drivers/generic/nusb22e.exe)

3. Após a instalação do programa, copie o arquivo USBSTOR.INF e cole na pasta WINDOWS\INF, substituindo o arquivo antigo. Faça isso através do Windows Explorer e observe que "WINDOWS\INF" é uma pasta oculta, portanto, ative a exibição de pastas ocultas no sistema;

(link = www.flashdrive.com.br/drivers/generic/nusb221e_upd.zip)

4. Plugue sua pen drive na porta USB. Se tudo correr bem o processo de reconhecimento do novo dispositivo iniciará e será finalizado com sucesso.

Fonte: http://www.pendrivenet.com.br